距离东京三百公里外的凤凰岛上，发生了一起人员被马匹踩踏而死的事件，谁知却让杉下右京（水谷丰饰）的老搭档神户尊（及川光博饰）找上门来。原来这座私人小岛正提供给有自卫队背景的某民兵组织作为训练基地，而该组织似乎涉嫌制造生化武器。神户受警察厅次长甲斐峰秋（石坂浩二饰）指派，命令杉下与搭档甲斐享（成宫宽贵饰

1999年，某个东西被卡车运出了馆山市。几天后，哥斯拉登陆了馆山，特生自卫队出动与之展开了苦战。在战斗中，自卫队员家城茜（釈由美子 饰）意外害死了战友叶山二尉（森末慎二 饰），自己却侥幸活了下来，并被派去了资料科。　　另一方面，日本政府在柘植真智子首相（水野久美 饰）的指挥下，召集了汤原德光（宅

　　正准备获得帝都大学的物理学教授的汤川学（福山雅治 饰）是一名不折不扣的物理学怪才，思维异于常人。这日，女警内海薰（柴崎幸 饰）接手了一单离奇的人体自燃案件，毫无头绪却又急于破案的她在同事草薙俊平的介绍下，找到了汤川学。汤川学本来不想惹麻烦上身，后来经不起内海薰的纠缠，终于答应和她携手破案。在经过

第二季的故事将从上一季最后一集的情节拉开帷幕。　　警视厅搜查一科“特别犯罪对策室”被迫解散，室长大泽绘里子（天海佑希 饰）引咎辞职，准备从成田机场出发回去美国，可是就在机场等待时她接到了野立信次郎（竹野内丰 饰）的电话。警界高官黑原健蔵将成为反政府组织“黑月”的下一个狙击目标，而“黑月”重要成员

金光闪耀的银座最近来了一个迷人的妈妈桑元子（米仓凉子 饰），她的店面有着阔气的装修，前来消费的不是高官就是大款。而她每一次陪伴客人，都会从谈话间搜集与金钱有关的情报，并把一切记录在她的黑色皮革笔记本里。　　元子以前是银行职员，凭着工作便利搜集了多年来银行内部所有空帐假账的人物名单。在盗用银行一亿

花店老板汐見英治（香取慎吾 饰）有个天使一样的女儿雫（八木优希 饰）。雫的母亲在生她的时候不幸去逝，留下父女俩相依为命。两个人的生活艰辛却也幸福，英治为人善良热情，深得周围人的喜爱，女儿同样在学校具有相当的号召力。　　在一个雨天，美丽的陌生失明女子白戸美桜（竹内结子 饰）出现在他们的生活里，从那