神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。

这部电视连续剧是以新一轮援疆为大背景和出发点，通过小人物反映大背景，描绘壮丽时代，叙述百姓生活，塑造平民英雄，讴歌民族团结。全剧通过一批援疆干部可歌可泣的故事，展现他们援疆3年间的喜怒哀乐，以及大爱无疆的精神风貌，是一部难得的援疆题材主旋律影视作品。